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主要用于进行单细胞多靶点的检测、分离、定量及各靶点之间的相互关系研究，而存在多靶点标记共定位时；背景强烈的自发荧光，使标记的微弱信号检测存在巨大的困难时；免疫组化或免疫荧光多种染色，很难检测每种标记信号，从而无法获取各靶点间的相互关系信息等。而多光谱显微成像技术可以同时获得多靶点的形态学信息、空间分布信息、各靶点定量信息等相互关系信息，且大大的提高检测的灵敏度和信噪比，实现“多信息数据挖掘”，从而完美的解决了传统成像技术无法进行定量分析的难题。

• 多光谱数据采集及高精度纯光谱图像拆分
• 符合统计学意义的全自动高精度可回溯样品立体信息学采样。
• 定量分析功能：能获得单位时间、单位面积发出的光子数，进行多种指标的定量分析；自动计算目标区域（ROI）荧光强度，区域范围，几何形状和相对位置并对图像进行复杂的计算和多种注解
• 可通过“样本训练”的方式建立软件算法，自动识别特定组织区域（例如自动区分肿瘤和基质，无需手工划分），并可以从特定组织结构区域中识别单细胞信号，并给出信号强度等信息；可实现大量样本的高效批处理分析；
• 同时进行多种标记时，可把每种荧光信号分离出来，并独立的、准确的进行定量；提供多种荧光强度的表达方式：蛋白表达多色荧光定量，荧光强度的单色表达以及伪色彩叠加的方式表达，表面标记物的空间共定位比率及分布分析。